Transposons Animation - DNA transposable elements
21. stoljeće je fantastično vrijeme za bioinženjere i strašno vrijeme za crnog nosoroga. Afrička vrsta, koja je prije više od 850 tisuća godina prije bila popraćena, ubrzano se smanjuje na oko 5.000 stanovnika. U nadi da će jednog dana premotati ovaj katastrofalni pad, biolozi pokušavaju prikupiti podatke o sekvenciranju diceros bicornis bicornis genoma.
Projekt je zajednički napor nekoliko biotehnoloških stručnjaka koji se bave očuvanjem, uključujući patologa Sveučilišta iz Washingtona i bioinžinara dr. Charlesa Murraya i Matthewa Markusa, predsjednika uprave Pembienta. Pembient je biotehnološka tvrtka u San Franciscu koja želi preplaviti kineska tržišta sintetičkim - ali biološki identičnim - rogom nosoroga, 3D tiskanim iz laboratorijskog keratina i možda isporučenog kao rino pivo. (Keratin je ono iz čega su napravljeni vaši nokti i rogovi nosoroga. Nije ni čarobno ni ljekovito.) Pembient je mogao naučiti dovoljno iz genoma jednog nosoroga nazvanog Ntombi, rekao je Markus Inverzan, za poboljšanje načina na koji sintetizira proteine nosoroga.
Ali prije nego što itko može pregledati genetiku Ntombi za podatke, crni genom nosoroga prvo mora biti sekvenciran. Projekt je otprilike na pola puta do podizanja $ 16,500 na Experiment.com, platformi za crowdfunding kao što je Kickstarter, osim za znanost umjesto oživljavanja dugoročnih video igara.
"Još uvijek je relativno malo organizama čiji su genomi sekvencirani", kaže Murray. "Do nedavno je to bilo vrlo teško - dugotrajno i skupo."
To ne znači da životinje ne postižu svoje genome. Projekt Genome 10K ima za cilj prikupiti Noino arku genetskih podataka. I južni bijeli nosorog, više naseljena i veća vrsta, imao je svoj genome sekvenciran u 2012. Ali što je s crnim nosorozima kao što je Ntombi? "Nije jasno zašto je crni nosorog tako dugo bio ostavljen na stranu", kaže Markus. On odbacuje propust do slučajnosti; ali moglo bi biti da, budući da su južnjački bijelci već bili sekvencionirani, crni nosorog nije bio prioritet.
Markus, Murray i njihovi suradnici nastoje taj jaz zatvoriti. Ntombi, plakat nosoroga za projekt, već je izvadio krv i sačuvao - i, bingo! DNK Rhino. Redoslijed bi trebao biti prilično jednostavan, rekao je Murray. "Velika je pomoć imati genom bijelog nosoroga kao mjerilo."
Sljedeći koraci u nizu
S Ntombijevom DNK koja je bila smještena na poslužiteljima DNAnexsus, biolozi su postavili temelje za komparativnu genomiku nosoroga. "Kada dobijemo njezin redoslijed, možemo početi shvaćati što nosoroga čini nosorogom, kako se bijeli razlikuje od crnog", kaže Murray, "i pruži informacije koje će pomoći u praćenju poširanih uzoraka."
Veterinari bi mogli provjeriti gene za potencijalno uzročnike bolesti, te imati osnovicu za usporedbu ostalih sedam podvrsta crnih nosoroga - od kojih su tri već izumrle.
Životinje nakon sutra
Jednom kada imamo čvršće razumijevanje genetike crnih nosoroga, nekoliko teoretskih vrata se otvaraju. "Niz cestu sam uzbuđen zbog korištenja matičnih stanica za razumijevanje fiziologije nosoroge i, potencijalno, za uzgoj rogova nosoroga u laboratoriju kako bi se smanjio krivolov", kaže Murray.
Markus prognozira malo dalje. Za diceros bicornis bicornis, Markus ne zamišlja toliko izumiranje u stilu mamuta, nego okreće genetski sat; što su manje populacije, to su skloniji nasljednim problemima.
A za crne nosoroge koji su nestali? On uspoređuje ovaj napor s onim za sekvenciranje sjevernog bijelog gena nosoroga, projekt koji se provodi u zoološkom vrtu u San Diegu. Govori se o pokušaju da se dobije južni bijeli nosorog (od čega ih ima 20.000) da nosi sjeverni bijeli nosorog (od čega ih ima 5) u pojam. Markus govori s opreznim, opreznim optimizmom: "Potencijalno - potencijalno - možda bi ponovno moglo oživjeti izumrla podvrsta crnog nosoroga."
Dlakavi majmuni su u opasnosti od izumiranja - kako ih znanstvenici planiraju spasiti
Tijekom proteklih 50 godina, gubitak staništa, krivolov i krijumčarenje za posvajanje kao kućne ljubimce desetkovali su kolumbijsku populaciju vunastih majmuna, čineći je teže i teže uočiti. Zbog toga su znanstvenici smislili način kako spasiti vrstu od izumiranja.
Honeybee "Wake-up Call": Zašto bi ih njihove vibracije mogle spasiti od izumiranja
Svjetske populacije pčela su u opasnosti - i to je strašna situacija za ljude. Znanstvenici su nedavno otkrili više o dobro poznatom, važnom signalu pčela, poznatom kao DVAV signal, koji bi mogao pomoći u praćenju zdravlja pčelinjih zajednica širom svijeta.
Rani Amerikanci mogli su spasiti bundeve od izumiranja
Nedavno postavljena teorija sugerira da bi bundeva izumrla, ako ne i za sjevernoamerikance. Istraživači sa Državnog sveučilišta Pennsylvania, Sveučilišta u Cambridgeu i Smithsonian Institution u Washingtonu objavili su Zbornik radova Nacionalne akademije znanosti Sjedinjenih Američkih Država.