Igrači igraju 'EteRNA' Samo pobijediti profesionalnu znanost na ovo ključno otkriće

Građanska znanost upravo je prešla sljedeću razinu: videoigraci su napravili biološko otkriće, a sada je objavio znanstveni časopis koji je pregledao stručnjak.

Objavljen ovaj tjedan u Časopis za molekularnu biologiju, niz intuitivno razvijenih pravila o tome kako će teško postići određeni oblik putem RNA dizajna. Otkrili su, na primjer, da što je simetričniji oblik, to će biti teže dizajnirati pramen RNK-a koji će ga odgovarati.

Kolektiv videoigara otkrio je igrom, Eterna, igra koja izaziva igrače da uzmu pramenove RNA i savijaju ih u željeni oblik mijenjajući svoj kemijski sastav. Znanstveni problem presavijanja RNA u određeni oblik je složen, ali igra nije - nije potrebno razumijevanje biokemije za početak igranja.

Igrači su se sami bavili istraživačkim pitanjem, kao način davanja novijim igračima alata za procjenu relativne poteškoće različitih zagonetki. Nalazi će pomoći u budućim biomedicinskim istraživanjima, budući da novi set pravila daje znanstvenicima bolji osjećaj o tome hoće li ili neće pokušati presaviti RNA u određeni oblik uzaludno.

"Ovo istraživanje sugerira da se standardna paradigma znanstvenog crowdsourcinga može preokrenuti", kaže Rhiju Das, profesorica biokemije na Stanfordu. Inverzan u e-pošti. Eterna 2011. pokrenuli su ga Das i Adrien Treuille, asistent na Sveučilištu Carnegie Mellon. „ Eterna igrači mogu osmisliti vlastita istraživačka pitanja i mogu napisati vlastite radove. U ovom istraživanju bilo je malo smjernica i neovisnih ispitivanja od strane stručnjaka u mom laboratoriju.

Sintetizirana RNA posjeduje nevjerojatan potencijal za novu generaciju lijekova i medicinskih terapija. Ako se može presaviti u pravi oblik, RNA se može izgraditi tako da cilja određene viruse, rak, pa čak i genetske poremećaje. CRISPR, proces uređivanja gena koji može dramatično promijeniti budućnost ljudske egzistencije, koristi RNK za usmjeravanje enzima za rezanje DNA, Cas9, u nepoželjni dio DNA.

Eterna je počeo kao forum za stručne znanstvenike koji su predstavili zagonetke igračima, ali je od tada narasla. Igra i njezinih 100.000 registriranih igrača sada postoje u simbiotičkom i razvijajućem odnosu s profesionalnim znanstvenicima i računalnim modelima izgrađenim za dizajniranje i testiranje RNA strukture.

„Računalno modeliranje i Eterna nisu isključivi “, kaže Das. „ Eterna okuplja mnogo ljudi, od kojih neki pišu vlastite računalne modele."

U ovom radu, igrači su zajednički napisali skripte kako bi testirali svoje ideje zbog čega je teško oblikovati RNA strukture. Das kaže da su mu neki igrači rekli da su posebno uzbuđeni što će svoje ideje automatizirati u računalne modele jer žele nastaviti rješavati teže probleme.

Problemi izgrađeni Eterna igrači se zapravo sintetiziraju u Dasovom laboratoriju - do sada je izgrađeno 86.459 sekvenci koje je stvorio igrač.

Glavni autori rada bili su Eterna igrači Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju i Michelle Wu. Wu je također i dr.sc. student biomedicinske informatike na Stanfordu.

U budućnosti bi moglo biti da građanski stručnjaci počnu objavljivati ​​znanstvena otkrića potpuno neovisno.

Ovaj predložak za građansku znanost mogao bi biti koristan za druge projekte i područja znanosti, kao što je astronomija (Zoološki vrt Galaxy) ili identifikacija vrsta koje potječu iz mase (Barkod života) ”, Kaže Das. - Osobito ako su Eterna, vide uska grla u fazi pisanja papira."